A partir del 28 de Enero de 2009 
DECANATOS:
Santiago: Pbro. Antonio Cárdenas Salinas
Santa Ana: Pbro. Daniel Martínez Acosta
Santo Niño: Pbro. Aristeo Olvera Maqueda
La Cañada: Pbro. Marco Antonio Cornejo Hernández
Amealco: Pbro. Nabor Fonseca García
San Juan del Río: Pbro. Jorge Rodríguez Escobedo
El Pueblito: Pbro. Ricardo Colín Negrete
Santa Rosa Jáuregui: Pbro. Silvestre García Suárez
San Miguel Arcángel: Pbro. Isaac Osornio Martínez
Soriano: Pbro. Víctor Ferro Moya
Guanajuato: Pbro. J. Gregorio Aguilar Vargas
Sierra: Pbro. Luis Serrano Ruíz
Por Oficio:
Vicario General: Mons. Salvador Espinosa Medina
Vicario General: Mons. Javier Martínez Osornio
Vicario Episcopal de Pastoral: Pbro. Fidencio López Plaza
Rector del Seminario: Pbro. Martín Lara Becerril
Vicario Episcopal para la Catedral: Cango. J. Guadalupe Martínez Osornio
Vicario Judicial: Pbro. Hugo Rayón Ortiz
Designados por el Sr. Obispo:
Representante de los Religiosos: Pbro. José Ma. Amenós Solsona, O.D
Prelatura de la Santa Cruz y Opus Dei: Pbro. Miguel Moya Ortiz
Comisión del Clero: Pbro. Mario Sánchez Guzmán, Pbro. Tomás Ramírez Felix
Economía Diocesana: Pbro. Alfonso Muñoz Torres
Santiago de Querétaro, Qro., Enero 23 de 2009.
† Mario de Gasperín Gasperín Obispo de Querétaro Hna. Lic. Ana Isabel Romero Ugalde, mjh Secretaria Canciller